苗縣府為開發科學園區周邊地區都市計畫，強拆大埔四戶，引發高度民怨。台灣農村陣線發起，連月都有聲援民眾以打游擊方式向中央首長陳情抗議，在8月18日更拉高抗爭強度，結束凱道兩萬人晚會後，帶領兩千人佔領內政部南棟大樓的門口。
佔領內政部的「拆政府」公民不服從非暴力運動，持續了20小時，8月19日下午五點半宣告階段性結束行動。台北大學教授廖本全老師說：這只是第一戰，接下來的目標在行政院及總統府。
政大地政系教授徐世榮老師反駁馬總統「尊重苗縣府作法」的說法，他認為大埔案牽涉到市計畫及土地徵收，中華民國都市計劃採二級制、土地徵收採一級制，中央都有核定權及主導權，豈能卸責？
台灣農村陣線發言人蔡培慧則說，佔領內政部後，散佈在大樓的貼紙及塗鴉不會主動清除，這些來自憤怒的人民心聲，要內政部官員看到，並要官員思考，一個公文簽呈就影響到一個人的家園去留，不能不審慎面對。
